组织工程软骨培养的细胞自动机算法模型与优化
1 杭州电子科技大学生命信息与仪器工程学院,杭州 310018
2 上海交通大学医学院第九人民医院,上海 200031
The Cellular Automata Model and Optimization Algorithm of Tissue Engineering Cartilage
1 College of Life Information Science & Instrument Engineering, Hangzhou Dianzi University, Hangzhou 310018, China
2 The Ninth People′s Hospital, College of Medicine, Shanghai Jiaotong University,Shanghai 200031, China
摘要 建立一个基于细胞自动机算法的软骨细胞和干细胞体外动态培养数学模型,并进行模拟计算与优化,为组织工程软骨的体外培养控制软件的编写提供理论依据。建立细胞自动机算法模型,采用软骨细胞和软骨干细胞作为研究对象进行Matlab仿真实验。实验分为3组,每组各自设置空白对照组、快速扩增组、力学刺激组、扩增与力学刺激复合培养组。空白对照组的结果显示,软骨细胞和干细胞诱导软骨细胞的细胞占空间区域分别为51%和45%;综合考虑细胞生长情况,软骨细胞培养最佳压强施加大小为100 kPa;干细胞诱导培养最佳压强施加大小为15 kPa。运用细胞自动机算法建立的数学模型来动态培养软骨细胞,可以为体外生物反应器控制软件的编写提供理论依据,对于组织工程培养软骨组织及其他器官培养是一种有效的可供参考的方法。
关键词 :
组织工程 ,
仿真 ,
细胞自动机算法 ,
软骨细胞
Key words :
tissue engineering
simulation
cellular automata algorithm
cartilage cells
基金资助: 上海自然科学基金项目 (09ZR1432700)
[1]Matsiko A, Levingstone TJ, O'Brien FJ. Advanced strategies for articular cartilage defect repair[J]. Materials, 2013, 6(2): 637-668.
[2]杨波,张安,曹峻岭. 组织工程修复关节软骨损伤研究进展[J]. 国外医学(医学地理分册),2007,1:1-6.
[3]李正章,程应樟,吴险峰,等. 周期性压力培养对兔骨髓间充质干细胞增殖的影响[J]. 中国组织工程研究与临床康复,2009,19:3628-3632.
[4]Couet F, Mantovani D. How to optimize maturation in a bioreactor for vascular tissue engineering: focus on a decision algorithm for experimental planning [J]. Annals of Biomedical Engineering,2010, 38(9): 2877-2884.
[5]赵其刚,李群湛,彭虎.小波神经网络在NGN流量预测中的应用[J].计算机工程,2006,32(16):20-22.
[6]柳松青. MATLAB神经网络BP网络研究与应用[J]. 计算机工程与设计,2003,11:81-83,88.
[7]闵克学,葛宏伟,张毅,等.基于蚁群和粒子群优化的混合算法求解TSP问题[J].吉林大学学报, 2006,24(4):402-405.
[8]詹士昌,徐婕,吴俊蚁. 群算法中有关算法参数的最优选择[J].科技通报,2003,19(5):381-386.
[9]刁元波. 复杂网络理论和细胞自动机在生物信息学中的应用研究[D]. 成都:四川大学,2007.
[10]黄文高,潘志庚.人工生命在计算机图形学中的应用[J].计算机辅助设计与图形学学报,2005,17(7):1383-1388.
[11]刘天庆,卜葛丹,程坊,等. 神经干细胞球生长动力学模型[J].中国生物医学工程学报,2006,25(6):708-716.
[12]冯海林. 生物病毒复杂系统定性仿真研究[D].合肥:中国科学技术大学,2007.
[13]赵峰, 陶祖莱. 生物模式的元胞自动机模型 (Ⅱ): 菌落的生长模式[J]. 生物医学工程学杂志, 2007, 24(4): 820-823.
[1]
赵亮1,2 陈红丽1 王勉1 解丽芹1 徐艳丽1 何孟1 冯志伟1 李敏1* . 蛛丝蛋白复合材料小直径血管支架的 [J]. 中国生物医学工程学报, 2016, 35(1): 88-95.
[2]
李进华1 杨英侃1 张林安2* 李建民1 王树新1 . 软组织吻合器手术缝钉排列优化设计 [J]. 中国生物医学工程学报, 2015, 34(6): 743-751.
[3]
柯丽* 李盼盼 陈红 刘欢 杜强. 颅骨对磁感应断层成像信号检测影响的仿真与实验研究 [J]. 中国生物医学工程学报, 2015, 34(5): 566-573.
[4]
陈卫东1,2 赵国志1,2 朱奇光1,2* . 基于自适应混合肝脏模型的建立 [J]. 中国生物医学工程学报, 2015, 34(3): 360-364.
[5]
赵亮1,2 徐艳丽1 何孟1 李敏1* . 骨髓间充质干细胞复合蛛丝蛋白血管支架构建小直径组织工程血管的研究 [J]. 中国生物医学工程学报, 2015, 34(1): 70-76.
[6]
陶蒙1 李文康1 李刚2 李宏1* . 组织工程角膜透明度检测方法研究与评价 [J]. 中国生物医学工程学报, 2014, 33(6): 764-768.
[7]
胥伟军 钱军民* 金欣霞. 蜂窝状聚氨酯支架的制备及性能评价 [J]. 中国生物医学工程学报, 2014, 33(5): 593-599.
[8]
郭红1 隋晓红1 李孟辉2 李丽明1* . 外部电场作用下的视神经纤维兴奋性的仿真研究 [J]. 中国生物医学工程学报, 2014, 33(5): 574-584.
[9]
赵明璨 刘畅* . 脂肪干细胞在软骨组织工程中的研究进展 [J]. 中国生物医学工程学报, 2014, 33(4): 475-481.
[10]
马腾1 陈爱政1 王士斌1,2* . 超临界二氧化碳流体发泡技术制备组织工程支架及其泡孔形貌控制研究进展 [J]. 中国生物医学工程学报, 2014, 33(4): 467-474.
[11]
李景峰1* 郑启新2 陈廖斌1表面矿化修饰煅烧骨/BMP2 活性多肽复合MC3T3-E1细胞构建组织工程骨 [J]. 中国生物医学工程学报, 2014, 33(3): 343-348.
[12]
巩长凤 侯雷 於学禅 吕静静 竺亚斌*. 组织工程平滑肌构建的研究进展 [J]. 中国生物医学工程学报, 2014, 33(1): 98-106.
[13]
陈红丽1 吕洁丽2 南文滨1&nb. 胶原/纤维蛋白胶/载BSA微球复合支架的制备及体外性能研究 [J]. 中国生物医学工程学报, 2014, 33(1): 79-85.
[14]
包敏1 周宇峰2 周祺惠1 董文1 张彦中1* . 超声可控释药体系研究进展 [J]. 中国生物医学工程学报, 2013, 32(6): 731-740.
[15]
李晓静1 王新木2 董研1* 苟中入3 . 基于壳聚糖的纳米材料在骨组织工程与再生医学中的研究进展 [J]. 中国生物医学工程学报, 2013, 32(5): 620-625.